"ISP (ICSP) программатор из Arduino" - читать интересную книгу автора (freeduino.ru/arduino/isp.html)

Прочие замечания

Архив с ПО также содержит файл sample.bat, в котором кроме bootloader’а программируются fuse и lock биты.

Более полную информацию можно найти по ссылкам:

http://www.geocities.jp/arduinodiecimila/bootloader/indexen.html

http://www.geocities.jp/arduinodiecimila/bootloader/indexolden.html